Jama ustna jest siedliskiem ogromnej ilości drobnoustrojów. Pomiędzy naszym układem odpornościowym a bakteriami trwa nieustająca wojna podjazdowa. Zwykle walka kończy się remisem tak, że drobnoustroje funkcjonują w ograniczonej liczbie, nie powodując jednak chorób. Nasz organizm bowiem dysponuje pewnymi skutecznymi środkami obrony do których należą:

•          Błona śluzowa – która wyściela całą jamę ustną stanowi barierę chroniąca przed atakami bakterii.

•          Złuszczanie nabłonka – bakterie, którym udało się skolonizować jamę ustną szybko są usuwane wraz ze złuszczającym sie nabłonkiem.

•          Substancje zawarte w ślinie – mają one właściwości bakteriobójcze, neutralizują toksyny oraz wiążą substancje niezbędnie do funkcjonowania bakterii, tak iż są one niedostępne dla drobnoustrojów.

•          Mechanizmy układu immunologicznego – polegają na produkcji przeciwciał przeciwko „intruzom”, fagocytozie, czyli bezpośrednie pożeranie drobnoustrojów przez wyspecjalizowane w tym komórki.

Niestety bakterie również dysponują bardzo skutecznymi środkami ataku. Nasilają destrukcję tkanek przyzębia w sposób bezpośredni i pośredni. Produkują bezpośrednio:

•          Enzymy – niszczące białka i inne substancje budujące tkanki przyzębia.

•          Toksyny: Egzotoksyny , Endotoksyny